MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 2176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	TGGT	2	8	65	72	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020297	GTA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020297	CTG	2	6	136	141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020297	CGA	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020297	AGGC	2	8	180	187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020297	CCG	2	6	203	208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020297	CAA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020297	TCT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020297	AAAG	2	8	381	388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020297	AG	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	451816789
11	NC_020297	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
12	NC_020297	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816789
13	NC_020297	GGA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816789
14	NC_020297	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816789
15	NC_020297	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
16	NC_020297	C	6	6	994	999	0 %	0 %	0 %	100 %	451816789
17	NC_020297	AGG	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816789
18	NC_020297	TCC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816789
19	NC_020297	C	6	6	1269	1274	0 %	0 %	0 %	100 %	451816789
20	NC_020297	C	8	8	1282	1289	0 %	0 %	0 %	100 %	451816789
21	NC_020297	CAGTT	2	10	1303	1312	20 %	40 %	20 %	20 %	451816789
22	NC_020297	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816789
23	NC_020297	CAG	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816789
24	NC_020297	GACG	2	8	1410	1417	25 %	0 %	50 %	25 %	451816789
25	NC_020297	AAGGT	2	10	1462	1471	40 %	20 %	40 %	0 %	451816789
26	NC_020297	TTG	2	6	1474	1479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816789
27	NC_020297	GCC	2	6	1548	1553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816789
28	NC_020297	ATG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816789
29	NC_020297	TGG	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816789
30	NC_020297	GAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
31	NC_020297	A	6	6	1909	1914	100 %	0 %	0 %	0 %	451816789
32	NC_020297	CGG	2	6	1937	1942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816789
33	NC_020297	CAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816789
34	NC_020297	TTA	2	6	1965	1970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816789
35	NC_020297	GTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816789
36	NC_020297	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	451816789
37	NC_020297	GAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816789
38	NC_020297	TGG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816789
39	NC_020297	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816789
40	NC_020297	CGC	2	6	2357	2362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816789
41	NC_020297	TGGCAT	2	12	2417	2428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451816789
42	NC_020297	T	6	6	2463	2468	0 %	100 %	0 %	0 %	451816789
43	NC_020297	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816789
44	NC_020297	CGG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816789
45	NC_020297	CAT	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816789
46	NC_020297	GCG	2	6	3008	3013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816789
47	NC_020297	GTG	2	6	3102	3107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020297	AAACT	2	10	3112	3121	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020297	ATT	2	6	3271	3276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020297	CTTA	2	8	3339	3346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020297	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020297	CAG	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020297	AAAG	2	8	3421	3428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020297	TTTA	2	8	3456	3463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020297	ATT	2	6	3481	3486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020297	GAA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816790
57	NC_020297	CAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816790
58	NC_020297	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816790
59	NC_020297	A	7	7	3785	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020297	A	7	7	3827	3833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020297	A	7	7	3847	3853	100 %	0 %	0 %	0 %	451816791
62	NC_020297	ACA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816791
63	NC_020297	TGA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816791
64	NC_020297	GCTGA	2	10	4167	4176	20 %	20 %	40 %	20 %	451816792
65	NC_020297	GCC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816792
66	NC_020297	GCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816792
67	NC_020297	CTG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816792
68	NC_020297	CGG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816792
69	NC_020297	CGAAGG	2	12	4354	4365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451816792
70	NC_020297	GGC	2	6	4397	4402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816792
71	NC_020297	CCGG	2	8	4430	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020297	GATG	2	8	4462	4469	25 %	25 %	50 %	0 %	451816793
73	NC_020297	TCGG	2	8	4495	4502	0 %	25 %	50 %	25 %	451816793
74	NC_020297	CTG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816793
75	NC_020297	CGC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816793
76	NC_020297	CGA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816793
77	NC_020297	A	6	6	4790	4795	100 %	0 %	0 %	0 %	451816793
78	NC_020297	GGC	2	6	4825	4830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816793
79	NC_020297	C	7	7	4838	4844	0 %	0 %	0 %	100 %	451816793
80	NC_020297	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	451816793
81	NC_020297	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816793
82	NC_020297	CAAT	2	8	5146	5153	50 %	25 %	0 %	25 %	451816793
83	NC_020297	TGGC	2	8	5166	5173	0 %	25 %	50 %	25 %	451816793
84	NC_020297	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816793
85	NC_020297	TACC	2	8	5216	5223	25 %	25 %	0 %	50 %	451816793
86	NC_020297	GGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816793
87	NC_020297	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816794
88	NC_020297	GGC	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816794
89	NC_020297	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816794
90	NC_020297	GACATC	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451816794
91	NC_020297	CCG	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816794
92	NC_020297	TGCCA	2	10	5502	5511	20 %	20 %	20 %	40 %	451816794
93	NC_020297	GGTT	2	8	5560	5567	0 %	50 %	50 %	0 %	451816794
94	NC_020297	GTAATC	2	12	5636	5647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816794
95	NC_020297	GCC	2	6	5668	5673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816794
96	NC_020297	TGG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816794
97	NC_020297	CGG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816794
98	NC_020297	GTG	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816794
99	NC_020297	G	6	6	5808	5813	0 %	0 %	100 %	0 %	451816794
100	NC_020297	CCA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816794
101	NC_020297	GGT	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816794
102	NC_020297	CAT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816794
103	NC_020297	CCG	2	6	6005	6010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816794
104	NC_020297	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816794
105	NC_020297	TGA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816794
106	NC_020297	GCCTTT	2	12	6142	6153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451816794
107	NC_020297	GGA	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816794
108	NC_020297	GCC	2	6	6315	6320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020297	ACC	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020297	TCCAA	2	10	6406	6415	40 %	20 %	0 %	40 %	451816795
111	NC_020297	AGT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816795
112	NC_020297	GGGA	2	8	6482	6489	25 %	0 %	75 %	0 %	451816795
113	NC_020297	CAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816795
114	NC_020297	AAACCC	2	12	6575	6586	50 %	0 %	0 %	50 %	451816795
115	NC_020297	TGG	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816795
116	NC_020297	CAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816795
117	NC_020297	GGC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816795
118	NC_020297	ACT	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816795
119	NC_020297	C	6	6	6875	6880	0 %	0 %	0 %	100 %	451816795
120	NC_020297	GTTG	2	8	6884	6891	0 %	50 %	50 %	0 %	451816795
121	NC_020297	GGA	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816795
122	NC_020297	CCA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816795
123	NC_020297	CAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816795
124	NC_020297	C	6	6	7021	7026	0 %	0 %	0 %	100 %	451816795
125	NC_020297	C	7	7	7063	7069	0 %	0 %	0 %	100 %	451816795
126	NC_020297	TGA	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816795
127	NC_020297	CAC	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816795
128	NC_020297	TGA	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816795
129	NC_020297	GCG	2	6	7210	7215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816795
130	NC_020297	TGGGC	2	10	7230	7239	0 %	20 %	60 %	20 %	451816795
131	NC_020297	TTC	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816795
132	NC_020297	GAG	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816795
133	NC_020297	ATT	2	6	7482	7487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020297	CTTT	2	8	7488	7495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020297	CTC	2	6	7527	7532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020297	T	6	6	7535	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020297	GGA	2	6	7550	7555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020297	GGC	2	6	7616	7621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816796
139	NC_020297	ACT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816796
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141	NC_020297	ACT	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816796
142	NC_020297	AAG	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816796
143	NC_020297	CCT	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816796
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149	NC_020297	G	6	6	8271	8276	0 %	0 %	100 %	0 %	451816796
150	NC_020297	GGC	2	6	8305	8310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816796
151	NC_020297	ACC	2	6	8340	8345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816796
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153	NC_020297	GGA	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816796
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159	NC_020297	TGG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816797
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400	NC_020297	ACA	2	6	20780	20785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816805
401	NC_020297	TCC	2	6	20790	20795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816805
402	NC_020297	TGC	2	6	20808	20813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816805
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404	NC_020297	TCT	2	6	21071	21076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816805
405	NC_020297	CGG	2	6	21085	21090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816805
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413	NC_020297	T	6	6	21530	21535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_020297	ATT	2	6	21683	21688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816806
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427	NC_020297	T	6	6	22158	22163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_020297	A	6	6	22512	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
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